235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1817 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  593  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  70.83 
 
 		 312 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  70.18 
 
 		 311 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  67.68 
 
 		 307 aa  387  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  68.09 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  68.09 
 
 		 316 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  64.59 
 
 		 316 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  68.44 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3309  hypothetical protein  67.84 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  61.27 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.49 
 
 		 297 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  53.21 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  41.24 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  33.22 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  35.92 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  32.99 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  32.99 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  32.99 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  32.99 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  32.99 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  32.99 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  31.97 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  32.65 
 
 		 303 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  33.33 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.12 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  31.58 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  31.49 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  32.72 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.84 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  32.75 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.72 
 
 		 315 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  28.87 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  34.04 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  27.18 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  33.56 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  31.58 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  28.32 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  30.41 
 
 		 310 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.48 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  31.92 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  29.51 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  28.57 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  32.23 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  31.6 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  29.11 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.29 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  31.86 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  31.94 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  32.48 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  32.48 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  32.48 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  28.71 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  31.18 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  31.76 
 
 		 307 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  30.82 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  31.03 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  27.24 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  27.82 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  29.01 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  32.06 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  32.4 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  32.97 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  31.71 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.69 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  34.2 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  26.35 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  26.35 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  30.43 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  33.11 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1619  integral membrane protein  27.24 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.971889  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.89 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  28.98 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  30.04 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  28.72 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0290  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0875  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2573  multidrug ABC transporter permease  30 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2437  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11208  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0322  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>