265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1712 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  52.74 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.86 
 
 
318 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  47.31 
 
 
290 aa  219  6e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.69 
 
 
312 aa  216  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  39.79 
 
 
309 aa  203  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  41.92 
 
 
310 aa  201  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.25 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 
300 aa  175  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  36.18 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.1 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.41 
 
 
289 aa  168  9e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  33.98 
 
 
319 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  34.31 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  32.75 
 
 
295 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  30.97 
 
 
296 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  31.96 
 
 
335 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  30.51 
 
 
293 aa  132  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  34.16 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.01 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  30.71 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  30.72 
 
 
303 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.81 
 
 
289 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  29.03 
 
 
298 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
283 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  30.36 
 
 
295 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2820  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
295 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.139235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1531  hypothetical protein  30 
 
 
295 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00178723  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  31.53 
 
 
305 aa  122  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  30 
 
 
302 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  31.69 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  27.34 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  29.64 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  31.69 
 
 
295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  30.48 
 
 
301 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  30.96 
 
 
301 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  29.35 
 
 
301 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  30.03 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  29.35 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  29.35 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  29.35 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  29.35 
 
 
303 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  29.35 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  29.35 
 
 
303 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  29.35 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  29.78 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  32.17 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 
308 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
308 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  28.94 
 
 
317 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
296 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  28.77 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
343 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  29.01 
 
 
303 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  24.74 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  27.11 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  31.05 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  28.18 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
313 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  31.87 
 
 
293 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  27.46 
 
 
298 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  27.5 
 
 
304 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  27.78 
 
 
358 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  26.92 
 
 
307 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  27.43 
 
 
316 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  26.96 
 
 
314 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  28.86 
 
 
299 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 
312 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  28.03 
 
 
307 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001539  permease  27.82 
 
 
292 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  27.34 
 
 
307 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  27.68 
 
 
307 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  27.34 
 
 
309 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
291 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 
308 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  28.83 
 
 
307 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
302 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  26.28 
 
 
297 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  27.55 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  27.02 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  28.48 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  29.82 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  26.28 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  29.76 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  27.82 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  28.28 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  25.18 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.93 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2243  hypothetical protein  27.62 
 
 
307 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0582742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  95.9  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  25 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1325  integral membrane protein  31.15 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  24.53 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>