275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  100 
 
 		 331 aa  651    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  63.99 
 
 		 309 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.28 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 312 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  29.18 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0417  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  28.16 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  24.91 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  27.3 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  27.64 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  29.04 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  26.17 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  25.35 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  28.68 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.86 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  25 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  30.66 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  28.83 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.97 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  27.75 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  25 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  25.69 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  27.17 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  25 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  25 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  25 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  25 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  26.48 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  31.46 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  26.3 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.12 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.48 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18490  DMT family transporter: drug/metabolite  31.8 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00171701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  26.22 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  25.52 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  26.64 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  26.12 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  26.46 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1261  hypothetical protein  27.98 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.647772  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  32.41 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  22.92 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  25.36 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.44 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0274  threonine/homoserine efflux transporter  30.05 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  23.19 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  25.32 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  27.94 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0994  hypothetical protein  25.36 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  27.84 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  25.52 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  26.67 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  27.76 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  27.45 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  25.78 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  27.03 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  23.55 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  25.35 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48145  predicted protein  31.36 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.196185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  26.36 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  25.35 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  30.87 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  24.81 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05469  hypothetical protein  25.46 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  27.49 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  29.43 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  27.31 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  24.92 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3002  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0425845  normal  0.73102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  27.01 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  28.1 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  29.14 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  25.48 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.5 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  30.11 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.05 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  24.05 
 
 		 300 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>