299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3336 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  632  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.69 
 
 		 303 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  70.34 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  55.64 
 
 		 296 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  54.79 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.99 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  46.05 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  39.42 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  37.58 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6123  hypothetical protein  41.1 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.79 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  33.22 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  29.9 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  29.9 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  29.9 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  31.38 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  29.57 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  32.34 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  29.57 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  29.9 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  29.24 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  28.9 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  31.16 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.39 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  28.67 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.08 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  30.69 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  29.62 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  27.91 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  27.76 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  27.8 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.94 
 
 		 313 aa  89.7  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36520  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  32.88 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  31 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 343 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  28.14 
 
 		 297 aa  85.9  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3301  hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00885964  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  28.52 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  30.6 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  27.3 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.25 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  27.68 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  25.44 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  29.18 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  26.95 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  31.05 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  29.2 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  29.2 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2471  hypothetical protein  28.42 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181629  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  28.83 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  30.41 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  31.83 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  30.35 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  31.29 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  28.77 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  30.89 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.27 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  26.42 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  29.46 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  30.85 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 304 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3937  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.16 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000721234  decreased coverage  0.000464529 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  25.48 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  25.26 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  31.29 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 304 aa  69.3  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  30.72 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  26.12 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  30.3 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  25.6 
 
 		 288 aa  67  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  28.38 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  24.75 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  33.1 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  25.6 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  26.99 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  25.85 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3154  permease  31.11 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  27.62 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  27.02 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>