277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_36520  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  100 
 
 
336 aa  629  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.47 
 
 
348 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3937  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.26 
 
 
309 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000721234  decreased coverage  0.000464529 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  38.33 
 
 
304 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6123  hypothetical protein  39.52 
 
 
302 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.64 
 
 
318 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  28.67 
 
 
307 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  35.74 
 
 
296 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  27 
 
 
314 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
297 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
315 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  33.22 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  32.54 
 
 
317 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  33.79 
 
 
292 aa  90.5  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  27.08 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  34.24 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  28.67 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  28.67 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  33.09 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  27.46 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.42 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  25.69 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.67 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  31.54 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  26.5 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.18 
 
 
295 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  25.19 
 
 
301 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.45 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  29.09 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  29.09 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  29.24 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  29.24 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  29.24 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  29.24 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  29.24 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  27.21 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  30.26 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  32.17 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  29.26 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  25.66 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  28.67 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.36 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.37 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  23.49 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  26.43 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  26.57 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.98 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  34.27 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  25 
 
 
322 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  28.47 
 
 
294 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  26.2 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  28.05 
 
 
300 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  27.09 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  26.15 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  28.57 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  26.76 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  30.1 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1123  hypothetical protein  23.42 
 
 
277 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  24.66 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  28.94 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  28.83 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  28.39 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  29.02 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  28.57 
 
 
331 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  28.47 
 
 
336 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  23.37 
 
 
295 aa  63.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 
347 aa  62.8  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.49 
 
 
290 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  28.16 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49268  predicted protein  25.28 
 
 
579 aa  62  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  28.92 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.46 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.01 
 
 
343 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  25.27 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  28.52 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  27.89 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  30.91 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  27.89 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2629  hypothetical protein  30.22 
 
 
295 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1564  hypothetical protein  27.74 
 
 
295 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.709521 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1470  hypothetical protein  30.26 
 
 
323 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635983  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  26.85 
 
 
288 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>