253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3937 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3937  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 309 aa  561  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000721234  decreased coverage  0.000464529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.04 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36520  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  54.23 
 
 		 336 aa  219  7e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  38.65 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  40.22 
 
 		 296 aa  126  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.5 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  39.21 
 
 		 319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  29.04 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6123  hypothetical protein  37.94 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  36.02 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  32.38 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  30.34 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.9 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  36.79 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.78 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  30.18 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.04 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  30.18 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  31.77 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  35.56 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  31.53 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.06 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  28.26 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  27.11 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  31.32 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  25.36 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  25.9 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  25.36 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  26.09 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  26.09 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.69 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  26.09 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  25.98 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  26.09 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  26.09 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  34.41 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1606  hypothetical protein  32.64 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  24.83 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  29.18 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  29.62 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  29.43 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  29.45 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.24 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  27.15 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  29.41 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  31.88 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  26.39 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.57 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4403  hypothetical protein  30.77 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0375849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  29.96 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  24.18 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  28.9 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  35.68 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  30.22 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.29 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  33.45 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  26.79 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  29.11 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  27.17 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  27.37 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1712  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.55 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  30.59 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  26.12 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  29.8 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  31.42 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  27.66 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  29.8 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  24.31 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  23.96 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  30.63 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1171  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.49 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149977  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  24.83 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  30.74 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  35.07 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.95 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  24.91 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  29.69 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  22.84 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  28.36 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>