293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4504 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 348 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36520  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  48.43 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.516696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3937  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.04 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000721234  decreased coverage  0.000464529 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  38.51 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  38.51 
 
 		 319 aa  139  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  39.57 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0940  integral membrane protein  32.85 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  36.33 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0232  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.97 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6123  hypothetical protein  37.32 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1421  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3027  DMT family permease  35.84 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  25.52 
 
 		 303 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  25.52 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  25.52 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  26.15 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  25.52 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  26.6 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  25.61 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  25.26 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  25.26 
 
 		 303 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  25.26 
 
 		 303 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  25.17 
 
 		 303 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  24.4 
 
 		 301 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  30.74 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  27.9 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  29.97 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.97 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  25.71 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.72 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.21 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  24.38 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  30.21 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  28.15 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  29.33 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  22.92 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  28.98 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  30.49 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  27.8 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  29.18 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  31.25 
 
 		 294 aa  79.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.58 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1560  hypothetical protein  29.62 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.590181  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  27.15 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  26.3 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  33.09 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  30 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  27.84 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.364061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  27.4 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  30.54 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  31.4 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.95 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  25.7 
 
 		 286 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  28.42 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  24.62 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  27.21 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  25.62 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  27.54 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  24.58 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.75 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  32.56 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  29.79 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1308  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  28.21 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  25.71 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  30.07 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1007  hypothetical protein  25.35 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  32.65 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  28.26 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2562  hypothetical protein  31.34 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0145  hypothetical protein  29.52 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  23.1 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  24.34 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  30.42 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  29.82 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  30.42 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  30.42 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.31 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  29.86 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.261978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>