More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1239 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  569  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  57.25 
 
 
293 aa  296  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  55.07 
 
 
283 aa  290  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  43.38 
 
 
307 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  38.89 
 
 
313 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 
313 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  35.42 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2398  hypothetical protein  36.07 
 
 
312 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0774988  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  30.88 
 
 
296 aa  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  32.77 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.13 
 
 
320 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.25 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.94 
 
 
300 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.74 
 
 
299 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  28.04 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.19 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  27.89 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  23.11 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  26.3 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.59 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  22.91 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.93 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  27.5 
 
 
294 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 
301 aa  79  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  26.26 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  26.48 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  26.26 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.38 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
355 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  27.4 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  24.54 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  25.59 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  26.47 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  26.52 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  26.52 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.05 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  26.14 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  26.91 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  29.69 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  25 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25.64 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  25.38 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  23.55 
 
 
317 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  25.38 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  26.28 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.78 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  24.73 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.69 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  27.76 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.28 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  25.93 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  23.91 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  25.57 
 
 
297 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.17 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  25.4 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  25.09 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  23.32 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.48 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.48 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  25.08 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.48 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  25.27 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  25.18 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.48 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  25.29 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  25.29 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  25.29 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  25.54 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  25.46 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  27.44 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  25.85 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.65 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.73 
 
 
291 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 
292 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  23.81 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  28.05 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  25.64 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  24.16 
 
 
314 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 
305 aa  62.8  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  23.91 
 
 
319 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  24.25 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  24.91 
 
 
294 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.33 
 
 
311 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  28.26 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.99 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.27 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.97 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  21.69 
 
 
288 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>