More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0529 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  584  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  97.32 
 
 
299 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  90.27 
 
 
302 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  90.27 
 
 
302 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  89.83 
 
 
297 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  89.6 
 
 
302 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  88.59 
 
 
302 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  88.59 
 
 
302 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  86.73 
 
 
299 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  77.85 
 
 
299 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.87 
 
 
286 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  63.7 
 
 
308 aa  359  3e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  65.44 
 
 
336 aa  343  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  64.24 
 
 
302 aa  338  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.17 
 
 
312 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.67 
 
 
308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  100 
 
 
154 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  100 
 
 
143 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  100 
 
 
143 aa  258  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  42.03 
 
 
320 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  43.31 
 
 
284 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  40.74 
 
 
316 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  40.59 
 
 
315 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  40 
 
 
318 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.66 
 
 
308 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.8 
 
 
315 aa  186  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  42.64 
 
 
307 aa  185  8e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  40.14 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  40.53 
 
 
318 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  41.9 
 
 
317 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 
299 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 
286 aa  152  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 
305 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.01 
 
 
305 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  30.9 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  31.97 
 
 
319 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  34.8 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.68 
 
 
299 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  35.43 
 
 
300 aa  125  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  31.29 
 
 
319 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  33.56 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  29.41 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  29.35 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  29.35 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  29.68 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  29.68 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.43 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  32.52 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  28.33 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.87 
 
 
303 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.05 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  30.07 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  30.07 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  29.77 
 
 
303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  31.42 
 
 
311 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.72 
 
 
303 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  29.43 
 
 
303 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.72 
 
 
303 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.07 
 
 
303 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.28 
 
 
293 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.37 
 
 
303 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  32.2 
 
 
309 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.41 
 
 
302 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.56 
 
 
315 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  33.79 
 
 
301 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.56 
 
 
309 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  29.49 
 
 
304 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.95 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
317 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  29.97 
 
 
312 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  29.62 
 
 
312 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.72 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.74 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 
289 aa  89.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  30.17 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 
355 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  29.8 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.56 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  29.8 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  29.8 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.61 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  32.49 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  24.09 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  30.08 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  25.79 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  30.77 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.71 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.95 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  25.1 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  25.1 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>