More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1205 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  43.06 
 
 
301 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  38.85 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.34 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  39.22 
 
 
300 aa  185  7e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  33.56 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  42.65 
 
 
301 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.05 
 
 
301 aa  175  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  42.29 
 
 
301 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.1 
 
 
330 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 
303 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  31.29 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  30.94 
 
 
322 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 
283 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.07 
 
 
299 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 
355 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.84 
 
 
299 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  27.65 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  23.23 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  27.8 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  30.8 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  27.15 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  26.56 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.11 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.79 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.33 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.49 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  25.7 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  28.63 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.52 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.51 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  27.04 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.21 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  30.67 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.08 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.77 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.45 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  25.69 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.97 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  26.1 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
315 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.86 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.27 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  30.14 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.69 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  26.69 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  25.41 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  28.03 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.5 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  26.05 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.24 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.13 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.13 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.84 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  25.99 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.03 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  21.4 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  30.14 
 
 
294 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.15 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  27.56 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.35 
 
 
307 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  29.29 
 
 
318 aa  62.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  26.48 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  27.46 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 
286 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.8 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  26.37 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  26.69 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.13 
 
 
299 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.59 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  26.37 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.54 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  28.31 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2398  hypothetical protein  26.91 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0774988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.23 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  25.64 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.93 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.91 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  25.38 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  25.36 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  25.7 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  26.72 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1985  integral membrane protein, DUF6  30.65 
 
 
308 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  25.18 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 
301 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>