292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1316 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
355 aa  685    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  55.63 
 
 
322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.03 
 
 
300 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.34 
 
 
303 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  39.75 
 
 
308 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  42.35 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  41.5 
 
 
301 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  41.83 
 
 
301 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  43 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.72 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  37.5 
 
 
300 aa  175  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.19 
 
 
330 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.82 
 
 
301 aa  159  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  31.75 
 
 
296 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  30.45 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
283 aa  92.8  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  27.16 
 
 
307 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  32.8 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  29.13 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  29.31 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  29.31 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  29.31 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  26.78 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  26.33 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  26.81 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  30.08 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  28.67 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  28.67 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.49 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  26.47 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.65 
 
 
315 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  30.65 
 
 
333 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  28.45 
 
 
299 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  28.09 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  30.87 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.97 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.32 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.26 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  25.08 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  29.22 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.76 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  25.89 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.6 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  26.14 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  27.43 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.23 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  32.22 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  29.13 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  25.09 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.03 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.49 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.34 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  23.7 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.11 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  31.43 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  28.33 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
304 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  23.95 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  24.39 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  22.11 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  27.08 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.03 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  24.04 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  24.04 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  24.04 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  30.37 
 
 
291 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  28.85 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  28.72 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  24.04 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  29.2 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  28.97 
 
 
325 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  25.55 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
299 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 
283 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.14 
 
 
293 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  24.01 
 
 
306 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  24.67 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  27.97 
 
 
316 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.58 
 
 
299 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0543  hypothetical protein  28.33 
 
 
271 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.530705 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  28.7 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  29.15 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  27.64 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  29.19 
 
 
287 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.13 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
305 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  23.03 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 
304 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 
335 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>