More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1953 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  87.66 
 
 		 308 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  86.54 
 
 		 312 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  72.45 
 
 		 308 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  72.51 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  65.97 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  66.32 
 
 		 302 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  66.32 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  66.32 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  66.32 
 
 		 302 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  64.93 
 
 		 297 aa  361  9e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.74 
 
 		 286 aa  355  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  66.1 
 
 		 299 aa  355  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  66.11 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  66.11 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  66.11 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  66.11 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  64.16 
 
 		 299 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  45.14 
 
 		 316 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  44.26 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  47.72 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.62 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  44.26 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  42.62 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  40.69 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  40.67 
 
 		 315 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  42.23 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  63.95 
 
 		 154 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  63.95 
 
 		 154 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  43.71 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  69.72 
 
 		 143 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  69.72 
 
 		 143 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.54 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.88 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  31.58 
 
 		 304 aa  125  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  31.58 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  30.77 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  31 
 
 		 319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  32.58 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  31.97 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  32.26 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.96 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.88 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.52 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  31.13 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  31.13 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  33.44 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  32.6 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.65 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  31.17 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  33.11 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.61 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  34.68 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.89 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  31.54 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  31.54 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.89 
 
 		 308 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  35.96 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.37 
 
 		 293 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  35.96 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  27.31 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  35.96 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  35.96 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.56 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  30.07 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.28 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  22.22 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  26.62 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.67 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  23.62 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.3 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  26.03 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  26.03 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.56 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  22.3 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  24.09 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  32.24 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.54 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25.52 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  25.78 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  25.18 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  28.24 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.82 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.18 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.82 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  22.18 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.29 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  25.18 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.59 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  27.74 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>