265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4618 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  612  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.23 
 
 
315 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  65.89 
 
 
333 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  65.73 
 
 
320 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  62.1 
 
 
318 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  65.79 
 
 
315 aa  364  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.52 
 
 
308 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  62.09 
 
 
318 aa  331  1e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  60.34 
 
 
307 aa  316  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  58.42 
 
 
284 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  44.78 
 
 
308 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  41.47 
 
 
302 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  41.14 
 
 
302 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  45.14 
 
 
336 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.17 
 
 
308 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.95 
 
 
312 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  40.47 
 
 
302 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  40.8 
 
 
297 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  43.86 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  40.47 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  40.47 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  41.58 
 
 
299 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  41.41 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  41.41 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  41.41 
 
 
299 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.56 
 
 
286 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  41.38 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  41.75 
 
 
299 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  41.84 
 
 
317 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
299 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  36.33 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30.98 
 
 
287 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 
305 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 
305 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 
286 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.59 
 
 
301 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.03 
 
 
296 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.13 
 
 
298 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  30.48 
 
 
300 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  40.15 
 
 
143 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  40.15 
 
 
143 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  43.42 
 
 
154 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  43.42 
 
 
154 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  27.44 
 
 
306 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  28.98 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  29.03 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  29.03 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  28.21 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  27.88 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  28.42 
 
 
304 aa  89.7  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.36 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  28.91 
 
 
311 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  28.42 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  27.83 
 
 
319 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  29.45 
 
 
309 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.82 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  24.91 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  26.84 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  32.05 
 
 
301 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.11 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  28.66 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.09 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.56 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.73 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  29.11 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  28.01 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  32.65 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  29.96 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.21 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  25.77 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 
330 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  32.02 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  32.02 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  32.02 
 
 
268 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.9 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.94 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.73 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.35 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  29.82 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.49 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.91 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  29.03 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.19 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.46 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.5 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.16 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.16 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  24.33 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  22.22 
 
 
309 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.59 
 
 
300 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>