246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2006 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  100 
 
 		 236 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  99.15 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  99.15 
 
 		 312 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  98.73 
 
 		 312 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  99.15 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  99.15 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  86.02 
 
 		 311 aa  352  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  78.39 
 
 		 319 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  77.12 
 
 		 319 aa  343  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  76.69 
 
 		 325 aa  337  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  75.85 
 
 		 310 aa  337  9e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  75.85 
 
 		 331 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  75.85 
 
 		 331 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  76.69 
 
 		 319 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.25 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.52 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.52 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.42 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  49.38 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.15 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  51.26 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  51.25 
 
 		 301 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  48.31 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  51.12 
 
 		 287 aa  177  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  48.92 
 
 		 294 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.07 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  32.22 
 
 		 302 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  38.2 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  31.38 
 
 		 302 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  30.6 
 
 		 297 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  30.54 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  30.54 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  39 
 
 		 307 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 315 aa  85.9  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  31.58 
 
 		 333 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 299 aa  85.5  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  33.47 
 
 		 317 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  29.71 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  33.52 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  33.52 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  33.52 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.8 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  28.75 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  35.96 
 
 		 336 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  30.26 
 
 		 307 aa  78.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  38.29 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  29.69 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.28 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  30.58 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  33 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  27.02 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  29.92 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  30.77 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  29.27 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.9 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.89 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.2 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.43 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.52 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  36.25 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  28.16 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  22.97 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.44 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  34.55 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  31.14 
 
 		 294 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  25.62 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  27.44 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  27.44 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.04 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  29.46 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.4 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  28.05 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  30.72 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  24.53 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  25.59 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  25.59 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.07 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  33.51 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  27.54 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  27.44 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  27.44 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  28.05 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  27.44 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  27.04 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.5 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  33.51 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.05 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  27.78 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  32.14 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  32.14 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.51 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>