254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2402 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  99.05 
 
 
315 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  67.87 
 
 
318 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  65.89 
 
 
316 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  66.56 
 
 
320 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  67.34 
 
 
318 aa  362  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  64.24 
 
 
315 aa  361  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.9 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  56.4 
 
 
307 aa  295  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  56.9 
 
 
284 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  40.13 
 
 
308 aa  189  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  41.75 
 
 
302 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  40.68 
 
 
297 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  39.86 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  40.4 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  40.4 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  40.07 
 
 
302 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  41.67 
 
 
302 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.82 
 
 
286 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  41.31 
 
 
336 aa  176  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42 
 
 
312 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  40.48 
 
 
299 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  40.14 
 
 
299 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  40.14 
 
 
299 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  40.14 
 
 
299 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.33 
 
 
308 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  39.07 
 
 
299 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  39 
 
 
317 aa  166  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  41.18 
 
 
299 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  27.83 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 
305 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.79 
 
 
305 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  31.77 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
286 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.13 
 
 
301 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.62 
 
 
319 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
298 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  28.38 
 
 
304 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  28.04 
 
 
304 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  27.99 
 
 
325 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  28.34 
 
 
331 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  28.34 
 
 
331 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.59 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  44.68 
 
 
154 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  44.68 
 
 
154 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  28.71 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30.61 
 
 
287 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 
299 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  27.76 
 
 
319 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  27.81 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  25.25 
 
 
304 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  29.05 
 
 
319 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  31.58 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  31.58 
 
 
236 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  37.5 
 
 
143 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  37.5 
 
 
143 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.42 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  31.46 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.96 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  26.56 
 
 
311 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  30.59 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  31.1 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  31.1 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  27.23 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  31.1 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  31.1 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  27.07 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  26.09 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  30.45 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.69 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.64 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.88 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  27.57 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.05 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.36 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.38 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.27 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.05 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  25.71 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  25.59 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  24.45 
 
 
306 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  26.32 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
330 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21.48 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.83 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  21.81 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  26.14 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.76 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  21.48 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  27.9 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.22 
 
 
341 aa  62.4  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  21.67 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>