More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01764 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.03 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.03 
 
 		 305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.33 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  56.79 
 
 		 287 aa  265  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.4 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  57.59 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  48.69 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  49.02 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.2 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  48.03 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  48.65 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  49.65 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  47.71 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  49.65 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  46.39 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  49.83 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  48.31 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  48.48 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  48.31 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  51.17 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  51.17 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  51.17 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  48.31 
 
 		 236 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  52.82 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.33 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  35.95 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  35.35 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  35.62 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  34.75 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  35.41 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  35.41 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  40.57 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  35.93 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  35 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  34.98 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  34.98 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  34.98 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  34.8 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.62 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  30.03 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  31.35 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  34.15 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  28.11 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  33.56 
 
 		 308 aa  99  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  32.24 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  29.52 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 312 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  33.21 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  27.81 
 
 		 333 aa  92.8  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.92 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  29.21 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  29.21 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  29.5 
 
 		 307 aa  85.9  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.08 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.04 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  31.25 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  28.39 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  29.69 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.91 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.24 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.22 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  28.76 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.15 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  30.91 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.59 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.53 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.87 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.83 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  29.18 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.24 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.24 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.61 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  30.42 
 
 		 284 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21.18 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  21.33 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  23.91 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.12 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  21.33 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  23.91 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25.69 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  24.91 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  24.26 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  24.91 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.17 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.7 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  24.81 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.81 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25.78 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>