More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1985 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  99.04 
 
 
312 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  98.88 
 
 
268 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  98.88 
 
 
268 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  98.88 
 
 
268 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  85.26 
 
 
311 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  98.73 
 
 
236 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  75.65 
 
 
319 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  77.48 
 
 
319 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  74.68 
 
 
325 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  76.53 
 
 
310 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  73.73 
 
 
319 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  76.53 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  76.53 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.13 
 
 
301 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.92 
 
 
299 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.14 
 
 
305 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.14 
 
 
305 aa  252  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.61 
 
 
298 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  52.6 
 
 
309 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  48.48 
 
 
296 aa  232  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  48.48 
 
 
300 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  51.62 
 
 
287 aa  225  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  51.64 
 
 
301 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 
286 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  48.43 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
286 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.75 
 
 
299 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  31.31 
 
 
302 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  31.31 
 
 
302 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  33.33 
 
 
317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  30.69 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  30.64 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  30.64 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  30.27 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  30.14 
 
 
299 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  29.97 
 
 
302 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  29.79 
 
 
299 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.8 
 
 
306 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  29.79 
 
 
299 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  29.79 
 
 
299 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  34.92 
 
 
288 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  36.62 
 
 
307 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
308 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 
312 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  31.94 
 
 
336 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2005  hypothetical protein  96.83 
 
 
63 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.692774  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  29.97 
 
 
299 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  28.01 
 
 
333 aa  99.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 
315 aa  99  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  29.1 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  29.39 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  27.4 
 
 
302 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  30.19 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  26.6 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  29.59 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  26.86 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  29.96 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  28.57 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.43 
 
 
305 aa  87  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  26.42 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  26.09 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  22.5 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  36.1 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  25.6 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21.79 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.62 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  22.14 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  29.6 
 
 
284 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  21.99 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.77 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  31.62 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 
330 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.29 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.32 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  32.63 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  21.69 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.08 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.45 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.33 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.37 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  23.68 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.49 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.16 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  23.67 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.08 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.61 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  21 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.95 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  28.08 
 
 
325 aa  66.2  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  30.34 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.55 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.18 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>