13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2005 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2005  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.692774  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  98.11 
 
 
312 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  98.11 
 
 
312 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  71.43 
 
 
311 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  71.11 
 
 
325 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  71.11 
 
 
310 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  71.11 
 
 
331 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  64.29 
 
 
319 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  71.11 
 
 
331 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  68.89 
 
 
319 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  66.04 
 
 
319 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  48.15 
 
 
291 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.63 
 
 
298 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>