More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0210 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  33.21 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.6 
 
 		 301 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  29.17 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  28.21 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  27.27 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  28.92 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  29.01 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  28.03 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  29.51 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.34 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.33 
 
 		 311 aa  75.5  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.92 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.48 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.39 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  28.91 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  28.91 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  28.91 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  29.01 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.34 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  30.11 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.87 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.28 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  30.11 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.87 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.21 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.71 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  29.67 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.6 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  26.37 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  26.37 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.46 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.55 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  28.9 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  28.9 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  28.9 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  28.05 
 
 		 336 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  25.34 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.03 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  29.44 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  25 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.25 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  26.99 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  26.35 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.11 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  29.2 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  28.09 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  23.53 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.13 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  26.33 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  26.29 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  29.2 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  25.7 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  30.1 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  25.7 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25.7 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.91 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  25.74 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  25.7 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  25.74 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.1 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  25.68 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.66 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  21.51 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.65 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  26 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.65 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.34 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.18 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  28.04 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  25.41 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  30.7 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  29.35 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  28.14 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>