More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4184 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  95.92 
 
 		 319 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  89.47 
 
 		 325 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  90.88 
 
 		 331 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  88.1 
 
 		 310 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  90.88 
 
 		 331 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  81.03 
 
 		 319 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  75.5 
 
 		 311 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  77.48 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  77.15 
 
 		 312 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  79.48 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  79.48 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  79.48 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  78.39 
 
 		 236 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.7 
 
 		 298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.1 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.1 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.15 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.24 
 
 		 299 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  51.01 
 
 		 296 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  54.18 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  53.68 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  49.02 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  53.49 
 
 		 301 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  50.6 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.04 
 
 		 286 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  31.62 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  31.08 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  31.08 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.32 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  32 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  31.06 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  31.67 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  30.67 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  30.38 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  30.38 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  30.38 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  32.58 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.29 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  31.29 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  31.41 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  30.59 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  32.68 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  36.4 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  28.86 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  27.6 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  28.16 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  27.76 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  25.84 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  31.49 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  30.14 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  25.84 
 
 		 304 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  28.08 
 
 		 318 aa  92.8  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  31.82 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  26.44 
 
 		 304 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  27.51 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  28.52 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.32 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  31.29 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  31.72 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.23 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.7 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  21.24 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.07 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  30.42 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.65 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  21.86 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  21.51 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.67 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  27.44 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.9 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.09 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  22.43 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.22 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.05 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  26.07 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  21.35 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  24.71 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.33 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.05 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  26.07 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.99 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.54 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  25.68 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  32.73 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  32.73 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.53 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  25.7 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>