More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2723 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  614  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  59.6 
 
 
313 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  47.67 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  47.67 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  47.33 
 
 
310 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.33 
 
 
310 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  47.33 
 
 
310 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  29.35 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  31.71 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.96 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  28.43 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  31.39 
 
 
300 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  28.43 
 
 
309 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  27.51 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2730  hypothetical protein  30.43 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23893  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  28.57 
 
 
311 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 
300 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.35 
 
 
302 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.89 
 
 
299 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.99 
 
 
329 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.21 
 
 
299 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  28.52 
 
 
299 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.88 
 
 
303 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.88 
 
 
303 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.16 
 
 
303 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  27.8 
 
 
303 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.1 
 
 
303 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.8 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.16 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  27.8 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  27.8 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  26.53 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.06 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.28 
 
 
293 aa  99  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.45 
 
 
315 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.34 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.94 
 
 
289 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  27.03 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.18 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.82 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  28.22 
 
 
303 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  25.34 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 
309 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.43 
 
 
311 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 
305 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.08 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  25.64 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  29.14 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  29.14 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.43 
 
 
341 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  30.19 
 
 
296 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.89 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  25.89 
 
 
314 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 
325 aa  85.9  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  27.87 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  26.32 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  29.63 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  24.58 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  26.4 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0584  hypothetical protein  27.12 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.42 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  26.6 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  27.49 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.19 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  30.86 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  26.3 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  26.3 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.15 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  25.82 
 
 
308 aa  79  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 
283 aa  79  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  25.34 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  28.52 
 
 
325 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  28.79 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  26.3 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  26.77 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  24.75 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  27.24 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  30.29 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  25.36 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  26.32 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  25.41 
 
 
328 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 
312 aa  75.1  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>