More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2691 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 299 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  82.94 
 
 		 298 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.82 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.82 
 
 		 305 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  63.86 
 
 		 287 aa  316  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.11 
 
 		 301 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  62.76 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  57.29 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  58.33 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  55.94 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  55.59 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  55.59 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  55.59 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  55.24 
 
 		 319 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  54.86 
 
 		 296 aa  265  8e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  54.2 
 
 		 319 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  53.15 
 
 		 319 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  51.92 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  52.26 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  51.05 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  53.12 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  53.12 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  53.12 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  50.42 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  53.62 
 
 		 294 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.85 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  34.03 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  34.8 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  34.8 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  34.8 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  33.67 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  35.05 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  34.69 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  34.69 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  34.68 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  34.35 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  32.77 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  33.22 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  32.88 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  38.55 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  34.03 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  32.21 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  32.87 
 
 		 336 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  32.14 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  28.77 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  33.67 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  29.11 
 
 		 304 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.45 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  31.11 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  29.55 
 
 		 320 aa  96.7  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  29.83 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  28.96 
 
 		 333 aa  96.3  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  28.9 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  30.32 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  29.13 
 
 		 318 aa  93.2  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  31.5 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.39 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  32.35 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  32.85 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.86 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.56 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.36 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  26.15 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.74 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.52 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.05 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.88 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  31.65 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  24.35 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  27.53 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.4 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  27.46 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.42 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  28.08 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.3 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.43 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  38.19 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  38.19 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  26.72 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  27.13 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.25 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.69 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.94 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.49 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.53 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.53 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.53 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.8 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>