More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0297 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  597  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.49 
 
 
320 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  61.86 
 
 
308 aa  363  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  50.72 
 
 
301 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.23 
 
 
330 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.04 
 
 
301 aa  256  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  50 
 
 
301 aa  255  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  50 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  41.61 
 
 
296 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  44.78 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.21 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.28 
 
 
300 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.51 
 
 
355 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  39.22 
 
 
317 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  39.57 
 
 
322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.82 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
283 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
303 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  30.98 
 
 
296 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  29.04 
 
 
313 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.34 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  26.94 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.78 
 
 
305 aa  90.1  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.47 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.33 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  29.19 
 
 
296 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  29.07 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.18 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  25.56 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  27.8 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  29.17 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.01 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  25.26 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  26.78 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  28.79 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.59 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.03 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.87 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.87 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.43 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.51 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.17 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.09 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  27.2 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  28.67 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  27.69 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  25.89 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.68 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  26.89 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  22.73 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.17 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.42 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  26.4 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  31.31 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  31.03 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  29.12 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.65 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  25.77 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  29.13 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  23.26 
 
 
306 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  22.92 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  22.92 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  25.37 
 
 
319 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  27.53 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.43 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  26.35 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.51 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  28.24 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  28.77 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  27.53 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  25.9 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  26.04 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  27.53 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.92 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.24 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  29.19 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  27.06 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  28.11 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  23.83 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  27.06 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  27.06 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  26.2 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.95 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>