More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2905 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  37.91 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.46 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  32.42 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  35.38 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  29.03 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  37.26 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  32.87 
 
 		 331 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.31 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  33.69 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  33.57 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  33.7 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.07 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  32.42 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  33.1 
 
 		 310 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  36.71 
 
 		 303 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  34.06 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  33.45 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  34.49 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  31.32 
 
 		 329 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  32.12 
 
 		 341 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  28.97 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  29.78 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.88 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  31.1 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  30.15 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  30.15 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  30.15 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  30.15 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  30.15 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  33.8 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  30.15 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  33.67 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.08 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.53 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 289 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  35.52 
 
 		 310 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  30.03 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.55 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  29.11 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  32.88 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.63 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  30.03 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.5 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  28.83 
 
 		 294 aa  89.4  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  31.74 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  32.28 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  32.06 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  26.57 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  29.86 
 
 		 293 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  29.86 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  29.14 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  27.08 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  25.34 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  26.28 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  35.25 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.43 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  30.45 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  32.29 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  30.03 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  32.37 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.21 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  29.27 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.69 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  28.24 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.43 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  26.69 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  30.27 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  22.78 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  28.77 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.1 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  23.36 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2576  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  30.1 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.08 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2730  hypothetical protein  31.46 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23893  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  30.04 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.05 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  22.99 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  33.83 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  22.63 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>