More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2576 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2576  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 321 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.25 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  33.57 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.08 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.62 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.52 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  31.11 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  31.74 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  27.84 
 
 		 309 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  29.01 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  27.3 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  27.54 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.37 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  29.5 
 
 		 306 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  28.52 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.52 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  31.25 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.52 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.41 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.41 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  30.11 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  27.78 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.04 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  29.54 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  27.74 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  27.7 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  29.82 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  26.69 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.26 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  26.69 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  27.37 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  26.69 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  26.69 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  26.69 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  27.78 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  26.69 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  27.78 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  27.3 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.68 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.71 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  23.93 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.49 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.86 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  24.1 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  27.69 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.88 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  28.73 
 
 		 341 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.46 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  27.01 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  24.1 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  26 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  27.3 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 305 aa  93.2  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  32.38 
 
 		 325 aa  92.8  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  26.8 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  28.21 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 292 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.06 
 
 		 341 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  27.33 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  28.41 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  26.15 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.72 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  28.18 
 
 		 296 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 297 aa  86.3  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.67 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  28.62 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  24.37 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  26.74 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  26.88 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  26.39 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.12 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  28.18 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.47 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  26.74 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.3 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.58 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  22.89 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  24.32 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.77 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>