More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2803 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  93.92 
 
 		 333 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  69.15 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  69.66 
 
 		 305 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  69.66 
 
 		 305 aa  374  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  69.18 
 
 		 305 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  48.97 
 
 		 290 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  48.62 
 
 		 293 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  48.62 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  48.8 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  47.24 
 
 		 297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  41.84 
 
 		 298 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  44.44 
 
 		 341 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.86 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.86 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  46.9 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  47.18 
 
 		 293 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  49.31 
 
 		 320 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  47.54 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  41.46 
 
 		 297 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  47.6 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  42.65 
 
 		 298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  42.29 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  43.01 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  43.01 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  49.13 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  41.58 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  49.13 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  49.13 
 
 		 302 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  42.86 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.18 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  46.15 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  42.65 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  41.18 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  40.83 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  41.18 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  42.01 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.58 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  33.57 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  32.2 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  34.15 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.03 
 
 		 329 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  31.51 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  29.35 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  31.21 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.3 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  29.82 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  28.52 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.5 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  27.5 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  30.85 
 
 		 345 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.87 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  30.66 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  29.37 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  32 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  30.18 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  28.27 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  27.97 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  28.22 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  31.25 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.03 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  29.5 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  26.6 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.64 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  25.68 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  26.22 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  26.22 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  26.22 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.86 
 
 		 317 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.57 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  26.22 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  25.87 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.32 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.16 
 
 		 310 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.8 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  27.34 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.89 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  27.21 
 
 		 322 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.63 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  27.86 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  30.41 
 
 		 324 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>