More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0926 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  598  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  55.75 
 
 
341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.92 
 
 
292 aa  290  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.19 
 
 
325 aa  285  9e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  50 
 
 
289 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.43 
 
 
292 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  40.89 
 
 
311 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  39.31 
 
 
315 aa  192  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  39.58 
 
 
325 aa  188  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  37.67 
 
 
304 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  40.69 
 
 
310 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  40.34 
 
 
310 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  36.66 
 
 
328 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  39.31 
 
 
315 aa  163  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  38.64 
 
 
330 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  32.39 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  32.04 
 
 
309 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  31.69 
 
 
309 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  31.82 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  33.8 
 
 
293 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  30.66 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 
283 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  30.88 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.35 
 
 
303 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.69 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  30.69 
 
 
302 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.01 
 
 
303 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.01 
 
 
303 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  30.88 
 
 
303 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.97 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  29.35 
 
 
303 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.35 
 
 
303 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  29.22 
 
 
312 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  30.51 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 
309 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  30.95 
 
 
311 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.6 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27.74 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.72 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.74 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  30.03 
 
 
308 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  27.02 
 
 
299 aa  119  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  31.44 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  30.96 
 
 
301 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  30.6 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  30.56 
 
 
322 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
291 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  31.68 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  31.68 
 
 
287 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  30.8 
 
 
301 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  33.81 
 
 
219 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 
317 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  27.27 
 
 
309 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  31.68 
 
 
287 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 
301 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  28.84 
 
 
331 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 
309 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  28.22 
 
 
306 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.37 
 
 
345 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  31.72 
 
 
310 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  29.18 
 
 
310 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 
287 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  28.98 
 
 
310 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.61 
 
 
299 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 
310 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  29.57 
 
 
310 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 
305 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 
302 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.12 
 
 
301 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  28.79 
 
 
310 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
305 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  27.85 
 
 
306 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  27.06 
 
 
309 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  26.76 
 
 
310 aa  99  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  26.92 
 
 
310 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  29.02 
 
 
319 aa  99  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.7 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
286 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  26.3 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  30.1 
 
 
341 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  27.08 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  27.02 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 
310 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.13 
 
 
305 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  27.87 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.36 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.64 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  25.99 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  27.08 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  30.47 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  28.78 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  28.47 
 
 
294 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.43 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.36 
 
 
294 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>