More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2528 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  564  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.01 
 
 
292 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  53.82 
 
 
341 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  50 
 
 
305 aa  275  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.71 
 
 
292 aa  262  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.65 
 
 
325 aa  261  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  42.71 
 
 
325 aa  211  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  42.27 
 
 
311 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  42.76 
 
 
310 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  42.41 
 
 
310 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  41.1 
 
 
315 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  40.77 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  41.73 
 
 
330 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  34.6 
 
 
328 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  38.91 
 
 
315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  30.21 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  28.62 
 
 
299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  32.88 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  31.75 
 
 
302 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  31.02 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  28.27 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  31.02 
 
 
303 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  31.02 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  31.02 
 
 
303 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.58 
 
 
293 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  30.1 
 
 
309 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  30.66 
 
 
303 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  30.66 
 
 
303 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  30.66 
 
 
303 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  30.66 
 
 
303 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  30.66 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  30.69 
 
 
297 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.82 
 
 
303 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  29.66 
 
 
309 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  31.83 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  29.45 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  34.62 
 
 
308 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  31.03 
 
 
313 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  29.76 
 
 
309 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  28.47 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  31.93 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  31.44 
 
 
310 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
291 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
300 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  30.38 
 
 
303 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  31.32 
 
 
312 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  30.24 
 
 
345 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 
309 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  30.34 
 
 
301 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  31.51 
 
 
306 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  26.99 
 
 
294 aa  102  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  27.3 
 
 
310 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 
283 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 
310 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  27.3 
 
 
310 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.77 
 
 
325 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  30.8 
 
 
305 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  30.96 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  26.95 
 
 
300 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  30.96 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  30.96 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  26.95 
 
 
310 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  30.96 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  30.96 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  30.96 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  30.07 
 
 
294 aa  99  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  26.95 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  30.17 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  28.77 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.02 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  28.82 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  30.69 
 
 
324 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  27.21 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  29.47 
 
 
331 aa  95.9  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
291 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
310 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  26.53 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  25.94 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 
307 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  28.47 
 
 
292 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.87 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.88 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.6 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.51 
 
 
294 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.52 
 
 
307 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1950  hypothetical protein  28.33 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.24178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.52 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>