More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3233 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.56 
 
 
302 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  70.23 
 
 
300 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  70.23 
 
 
300 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.18 
 
 
289 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  65.89 
 
 
300 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  67.89 
 
 
302 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  50.85 
 
 
296 aa  278  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.96 
 
 
312 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  51.42 
 
 
317 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3051  DMT family permease  56.31 
 
 
321 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.300875  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  46.15 
 
 
319 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  44.15 
 
 
297 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  38.16 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  41.92 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  38.83 
 
 
299 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  37.46 
 
 
309 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  36.03 
 
 
293 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  34 
 
 
301 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
309 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  36.27 
 
 
313 aa  159  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  33.89 
 
 
345 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.17 
 
 
291 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  33.89 
 
 
306 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  34.83 
 
 
297 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.05 
 
 
301 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  37.54 
 
 
294 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  36.21 
 
 
310 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.77 
 
 
317 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  35.91 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  35.37 
 
 
301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  35.21 
 
 
294 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  36.04 
 
 
312 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  34.41 
 
 
331 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  37.59 
 
 
310 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 
309 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  33.56 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  36.04 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  36.04 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  36.04 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  36.04 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  36.04 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  36.04 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.02 
 
 
310 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  30.43 
 
 
309 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  35.12 
 
 
311 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  34.84 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.33 
 
 
314 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.83 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  38.36 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  30.45 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  34.21 
 
 
303 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
298 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  31.34 
 
 
303 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  31.34 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  31.34 
 
 
303 aa  123  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  30.97 
 
 
303 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  30.97 
 
 
303 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  30.97 
 
 
303 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  33.89 
 
 
309 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
305 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  30.97 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  30.97 
 
 
303 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  30.97 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.97 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  28.23 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  32.75 
 
 
290 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.77 
 
 
314 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.77 
 
 
325 aa  113  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  29.33 
 
 
298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  32.41 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  32.06 
 
 
293 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  31.71 
 
 
293 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  30.1 
 
 
309 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  34.34 
 
 
312 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  32.17 
 
 
297 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  31.93 
 
 
297 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  26.41 
 
 
341 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
307 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  32.73 
 
 
322 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  31.06 
 
 
297 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  30.25 
 
 
297 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  34.21 
 
 
315 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  26.09 
 
 
296 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  30.9 
 
 
319 aa  99.8  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 
333 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  32.73 
 
 
310 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  28.32 
 
 
296 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  26.58 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  26.48 
 
 
305 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.16 
 
 
299 aa  96.3  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2730  hypothetical protein  30.69 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>