270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4694 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 310 aa  588  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  93.87 
 
 		 310 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  93.23 
 
 		 333 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61 
 
 		 314 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  61.2 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  61.92 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  47.92 
 
 		 325 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  46.58 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.76 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.12 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  48.42 
 
 		 297 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.78 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  36.07 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  36.21 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  37.07 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  36.93 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.28 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  35.25 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  34.86 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  36.82 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  35.89 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  34.97 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  34.23 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  30.21 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  36.16 
 
 		 294 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  33 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  34.25 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  29.53 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  31.76 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.76 
 
 		 291 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  29.19 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  31.79 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  27.74 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  34.33 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.6 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  32.21 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  32.8 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  27.18 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  35.18 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  33.22 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.97 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.32 
 
 		 329 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  32.54 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.55 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  31.12 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  32.75 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  30.95 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  31.56 
 
 		 319 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  33.1 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  32.33 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  30.82 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  32.49 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.18 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  31.45 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  34.66 
 
 		 325 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  30.57 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  38.11 
 
 		 314 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  31.69 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  30.14 
 
 		 296 aa  97.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.46 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  28.47 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  28.86 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  28.79 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  34.09 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.21 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  30.96 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  30.27 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  29.79 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  28.86 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.42 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  27.3 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  32.97 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.09 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  30.03 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.23893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  29.72 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  33.44 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  32.57 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.21 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  33.46 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  28.08 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  33.46 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.21 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>