More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0572 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  73.38 
 
 		 293 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  73.72 
 
 		 293 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  73.1 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  73.04 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  66.89 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  65.54 
 
 		 296 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  67.01 
 
 		 293 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  66.78 
 
 		 293 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  52.86 
 
 		 299 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  50 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  46.1 
 
 		 298 aa  235  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.26 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  46.15 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  47.16 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  46.74 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  46.74 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  46.45 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  47.67 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  46.1 
 
 		 296 aa  221  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  41.13 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.81 
 
 		 296 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  46.45 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  46.1 
 
 		 296 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  45.74 
 
 		 296 aa  215  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  46.45 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  40.43 
 
 		 341 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  37.84 
 
 		 301 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.67 
 
 		 333 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  46.1 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  38.3 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  39.45 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  43.86 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  44.33 
 
 		 302 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.54 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.54 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  43.97 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  43.97 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  34.16 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  33.7 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  33.45 
 
 		 303 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  34.74 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  32.89 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  33.22 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.88 
 
 		 291 aa  135  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  33.22 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  31.65 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  30.91 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  31.56 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  32.61 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  30.53 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  32.08 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.05 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.1 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  31.31 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  33.94 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  33.33 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  31.43 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  31.64 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  30.28 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  26.96 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  32.28 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  30.54 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  31.43 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  30.29 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 314 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  32.75 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  32.63 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  29.72 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.79 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.93 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.57 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  28.57 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.57 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.87 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.21 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.47 
 
 		 303 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.21 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.21 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  29.45 
 
 		 341 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.56 
 
 		 310 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.11 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>