More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1524 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  591  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  99.67 
 
 		 305 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  97.05 
 
 		 305 aa  503  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  84.25 
 
 		 309 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  69.66 
 
 		 297 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.04 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  51.55 
 
 		 293 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  51.72 
 
 		 290 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  50.86 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  48.43 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  48.45 
 
 		 293 aa  242  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  46.76 
 
 		 293 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  49.14 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  40.89 
 
 		 341 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  46.76 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  43.34 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.52 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.52 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  48.81 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  48.94 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  42.12 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  46.74 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  41.49 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  40.21 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  43.01 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  38.28 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  43.01 
 
 		 296 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  42.96 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  47.89 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  42.76 
 
 		 296 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  42.51 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  42.96 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  43.21 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  42.25 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  47.54 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  47.54 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  35.92 
 
 		 303 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  32.5 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  35.88 
 
 		 331 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  31.83 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 309 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  30.74 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  32.16 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  32.75 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.37 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  31.07 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  31.16 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  30.04 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  30.25 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  30.25 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  30.25 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  30.6 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  30.25 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  30.25 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  30.25 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 305 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  32.14 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 		 317 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.33 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  29.17 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  30.1 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.82 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  31.8 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  30.1 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  29.43 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.82 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  30.25 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  32.97 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  29.71 
 
 		 322 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.34 
 
 		 298 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  30.11 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  30.74 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  30.11 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  30.11 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  30.07 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  30.11 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.75 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  30.18 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.87 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  31.38 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.88 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  31.07 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  30.25 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.64 
 
 		 301 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  28.47 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>