More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1415 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  100 
 
 		 305 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  97.05 
 
 		 305 aa  534  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  96.72 
 
 		 305 aa  532  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  83.56 
 
 		 309 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  69.66 
 
 		 297 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.04 
 
 		 333 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  51.2 
 
 		 293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  51.72 
 
 		 290 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  50.52 
 
 		 293 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  48.78 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  49.14 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  47.78 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  49.48 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  43.73 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  46.9 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  40.96 
 
 		 341 aa  232  5e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  48.63 
 
 		 296 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.19 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.19 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  48.24 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  42.23 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  47.08 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  39.46 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  42.91 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  40.78 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  42.91 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  38.16 
 
 		 301 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0909  hypothetical protein  43.1 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3381  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.16 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0926  hypothetical protein  42.96 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  42.86 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3454  hypothetical protein  42.16 
 
 		 296 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  42.25 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3578  hypothetical protein  42.51 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0917112 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  47.18 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  46.83 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  46.83 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.02 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  35.56 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  32.14 
 
 		 345 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  35.13 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  31.96 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  30.39 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  32.14 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.22 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  30.74 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  33.1 
 
 		 308 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.37 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  31.77 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  30.6 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.16 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  30.8 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  29.33 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  30.55 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  30.55 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  30.55 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  30.55 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.68 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  30.55 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  30.55 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  30.29 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.47 
 
 		 329 aa  109  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  29.86 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  28.92 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  29.08 
 
 		 297 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  30.74 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  32.97 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.41 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.55 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.87 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.54 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.39 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.39 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  31.34 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.75 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.39 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  29.75 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  29.74 
 
 		 324 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.37 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  28.22 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.39 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.37 
 
 		 303 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 314 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  29.54 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  28.27 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  28.37 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>