275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1426 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  577  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  67.73 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.54 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  60.8 
 
 		 300 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  62.37 
 
 		 300 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  59.8 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.55 
 
 		 289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  48.49 
 
 		 296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.38 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  47.83 
 
 		 317 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  43.79 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3051  DMT family permease  51.46 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.300875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  44.04 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  41.98 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  37.33 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  36.62 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  37.87 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  35.57 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  37.54 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  33.57 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  35.62 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  33.77 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  33.22 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 301 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  30.52 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  33 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.88 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  31.25 
 
 		 331 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  34.11 
 
 		 306 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  31.49 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  33.45 
 
 		 313 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.77 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.12 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  30.3 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  35.71 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  33.69 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  33.92 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  33.79 
 
 		 322 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  29.17 
 
 		 325 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  35.15 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  32.77 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  32.76 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  32.87 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.76 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  35.44 
 
 		 314 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  29.49 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  29.49 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.44 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  32.87 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  32.87 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  32.87 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  32.87 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  32.87 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  32.87 
 
 		 312 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  30.69 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  30.34 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  30.34 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  27.14 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  30.34 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.15 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  30.18 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.26 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.46 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  32.76 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  27.67 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  31.08 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  30 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  32.09 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  29.08 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  32.98 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  28.2 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  29.08 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  27.8 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  29.08 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.98 
 
 		 333 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  31.52 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  28.52 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  29.33 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.73 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  29.89 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  29.79 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  25.74 
 
 		 341 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  27.44 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  28.89 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  26.85 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>