295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4552 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4552  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 333 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.629192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4181  hypothetical protein  99.35 
 
 		 310 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4694  protein of unknown function DUF6 transmembrane  93.23 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.119165 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8133  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.97 
 
 		 314 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.512786  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  60.87 
 
 		 322 aa  300  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  60.19 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  48.26 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.64 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  44.97 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.3 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  48.42 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.36 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  36.42 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  35.89 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  35.33 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  36.86 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  36.03 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 301 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  34.85 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  35.66 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  35.66 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  36.82 
 
 		 308 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 317 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.05 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 		 312 aa  132  9e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  36.67 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  34.23 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  30.07 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  32.56 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1370  hypothetical protein  33.11 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.67 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5389  hypothetical protein  34.45 
 
 		 300 aa  119  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.716094  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.42 
 
 		 291 aa  119  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  31.82 
 
 		 319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  28.1 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  32.65 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  33.22 
 
 		 310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  34.15 
 
 		 293 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.1 
 
 		 300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  28.18 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  33.68 
 
 		 296 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  28.77 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  32.49 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.41 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.21 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 301 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  30.32 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  27.21 
 
 		 298 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  30.24 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  32.63 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.97 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1227  hypothetical protein  34.28 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  32.61 
 
 		 294 aa  106  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  39.51 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  33.45 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.07 
 
 		 305 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  34.66 
 
 		 325 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  31.78 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  30.94 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  31.8 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 298 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  30.07 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  29.03 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  28.86 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.5 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  31.34 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  31.6 
 
 		 302 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  30.36 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  31.32 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  27.7 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.08 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  32.38 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1091  hypothetical protein  28.42 
 
 		 296 aa  96.3  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 		 297 aa  96.3  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  32.52 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.42 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4444  hypothetical protein  29.17 
 
 		 293 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.79 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.42 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  29.02 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0924  hypothetical protein  28.67 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  28.05 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  30.8 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.26 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  30.53 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  33.45 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  34.67 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1547  hypothetical protein  32.75 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251436  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6282  hypothetical protein  32.75 
 
 		 302 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0693319  normal  0.604929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  29.84 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  34.33 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  34.11 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>