More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0478 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  627  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.41 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.39 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.25 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  43.51 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  40.94 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  39.72 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  44.2 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  42.96 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.02 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  36.33 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  31.6 
 
 		 296 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  31.14 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.53 
 
 		 304 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.95 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  27.8 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.85 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  24.41 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.39 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.97 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.76 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.83 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.9 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  29.95 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  23.86 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  24.57 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  23.86 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.78 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.16 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.93 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.96 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  22.97 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.16 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.5 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  23.96 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  25.9 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.44 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.93 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  24.23 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  26.26 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.9 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.51 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  26.67 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  26.28 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.16 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  24.71 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.16 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.87 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  28.63 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  31.56 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.22 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  29.57 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.61 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.04 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  26.22 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  27.24 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  29.12 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.64 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  26.47 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  28.52 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  28.93 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  28.93 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.05 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  27.63 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  25 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.82 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  25.57 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  24.03 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.32 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  30.31 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  25.57 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.5 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  26.21 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  23.71 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  24.48 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  22.63 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  26.52 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1322  hypothetical protein  27.49 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  24.23 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  27.11 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>