More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6176 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.59 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  31.69 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.25 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  31.1 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  31.1 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  28.98 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.64 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.99 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  30.22 
 
 		 313 aa  90.1  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.92 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  24.16 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  25.72 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  26.78 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  27.11 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.7 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.37 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.83 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  24.43 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  26.56 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  27.68 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  27.56 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  22.97 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  23.99 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.4 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.72 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.44 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  26.79 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  25.77 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  25.18 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  27.49 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  27.5 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.19 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.25 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  24.48 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  25.5 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  28.52 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  25.57 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  26.82 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.67 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  25.87 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  25.09 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25.17 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.78 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  24.66 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  29.59 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  28.06 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  22.71 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  25.72 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  26.28 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.81 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.74 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  24.74 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.33 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  24.83 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  26.22 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  26.62 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.89 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.5 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.5 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  25.57 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  23.18 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  26.74 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  23.21 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  24.24 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0798  integral membrane protein  25.26 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.252294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  24.65 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  25.27 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  27.34 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  25.98 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.18 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.76 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  25.1 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  25.1 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  25.1 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.21 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0350  hypothetical protein  28.65 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0332  hypothetical protein  28.65 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>