More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2387 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 303 aa  590  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  44.21 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  41.61 
 
 		 308 aa  221  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.05 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  45.49 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.52 
 
 		 355 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  45.49 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.13 
 
 		 320 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.89 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  43.39 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  41.54 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  45.22 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.56 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  38.87 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  33.45 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  27.74 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.12 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.83 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  30.45 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  28.33 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  26.57 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  25.43 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.92 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2398  hypothetical protein  25.08 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0774988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.25 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  22.41 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  27.23 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.75 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.12 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  30.58 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  27.33 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.75 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  26.94 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  29.21 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  29.26 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  27.4 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.32 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  26.62 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  27.34 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  26.24 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  27.6 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.41 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.72 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.28 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  27.34 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  30.66 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  25.86 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.08 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.62 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  25.63 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.32 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.32 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.41 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  27.01 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.32 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  26.32 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  25.86 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.66 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.91 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  25 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  28.12 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.69 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  26.38 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  26.86 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  22.76 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  25.71 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  25.98 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  25.98 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  23.3 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  23.6 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.54 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.86 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  25.72 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  25.86 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  26.96 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.18 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  28.86 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.92 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  25.25 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  28.97 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.16 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>