More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0610 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
313 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  26.58 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.83 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.52 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.49 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  24.15 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.98 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.41 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  25.11 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  25.68 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  23.72 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  22.65 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.64 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.71 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.24 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  19.8 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  23.15 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  28.23 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  25.96 
 
 
292 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  24.92 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  26.56 
 
 
296 aa  63.5  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  22.33 
 
 
309 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  27.31 
 
 
294 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.6 
 
 
303 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  24.9 
 
 
320 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.76 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  22.3 
 
 
308 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 
311 aa  62.8  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  25.78 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  25.38 
 
 
304 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  27.75 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25 
 
 
294 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  25.77 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.94 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.43 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.94 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.87 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  27.18 
 
 
297 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.21 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  27.75 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.83 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.83 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.32 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  24.26 
 
 
304 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  23.56 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  24.26 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.55 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  24.26 
 
 
304 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  29.56 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  25.99 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  22.71 
 
 
341 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  25.99 
 
 
294 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  25.18 
 
 
301 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  27.17 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  24.62 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  30.35 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.28 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.68 
 
 
305 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  28.85 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  28.44 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  30.35 
 
 
293 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  23.56 
 
 
283 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.3 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  29.44 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  24.07 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  24.49 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  28.44 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  23.86 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.42 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.44 
 
 
308 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  26.89 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  25 
 
 
299 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 
286 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.61 
 
 
319 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.6 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  23.24 
 
 
333 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 
289 aa  56.2  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  23.08 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  22.34 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.24 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  24.79 
 
 
319 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  25.55 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.7 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 
293 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  24.47 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  25.45 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 
292 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>