267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3720 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
293 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  98.63 
 
 
293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  98.29 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  97.95 
 
 
293 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  89.66 
 
 
294 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  85.52 
 
 
294 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  90.41 
 
 
294 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  89.35 
 
 
294 aa  494  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  77.51 
 
 
292 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  74.22 
 
 
297 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  73.26 
 
 
292 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  70.24 
 
 
290 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  67.82 
 
 
293 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  70.69 
 
 
296 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  53.5 
 
 
298 aa  301  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  49.48 
 
 
288 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  48.42 
 
 
291 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  86.43 
 
 
145 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  38.75 
 
 
293 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.29 
 
 
282 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  32.34 
 
 
299 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  31.05 
 
 
283 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  30.68 
 
 
309 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
296 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  30.9 
 
 
297 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  28.37 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  26.69 
 
 
309 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.85 
 
 
289 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.35 
 
 
315 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.17 
 
 
290 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  28.47 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  25.89 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  29.54 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  29.18 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  29.18 
 
 
296 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  26.58 
 
 
296 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  27.92 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  29.08 
 
 
296 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  28.83 
 
 
296 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  22.81 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.06 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.06 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  25.17 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.94 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  26.98 
 
 
304 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  22 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  24.07 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  27.9 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  22.99 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  21.4 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  21.4 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.37 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  22.48 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.61 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.87 
 
 
300 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  25.72 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.58 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  21.92 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.62 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  22.86 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  26.53 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  25.59 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.47 
 
 
313 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  25.26 
 
 
296 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  22.94 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 
329 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.04 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  24.3 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  25.08 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  21.4 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  27.12 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.55 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.19 
 
 
294 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  26.28 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  21.62 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  26.21 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  26.21 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  24.73 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.99 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  24.82 
 
 
318 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.44 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.75 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.67 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 
317 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  23.74 
 
 
305 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  25.78 
 
 
343 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>