252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3035 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  68.97 
 
 		 292 aa  408  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  68.17 
 
 		 293 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  68.51 
 
 		 293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  68.29 
 
 		 294 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  68.17 
 
 		 293 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.82 
 
 		 293 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  69.18 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  67.13 
 
 		 297 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  67.13 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  63.99 
 
 		 290 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  70 
 
 		 296 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  67.72 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  68.07 
 
 		 294 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  58.21 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  48.96 
 
 		 288 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  47.18 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  69.92 
 
 		 145 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  36.49 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  30.07 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  34.27 
 
 		 283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  32.84 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  32.74 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.33 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  31.56 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  31.56 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  26.86 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  29.21 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  30.39 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  30.74 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  24.5 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  29.63 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  22.86 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  29.54 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  30.74 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.72 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  30.5 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  30.73 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.39 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.8 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  22.48 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.91 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.16 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  24 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  26.15 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  26.54 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  25.11 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.7 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  24.64 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.6 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.6 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24.26 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.35 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.26 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  27.94 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  26.48 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.84 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  25.68 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.56 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  24.81 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  23.08 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  22.94 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  23.03 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.43 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.76 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  27.18 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  22.77 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  27.18 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  25.84 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  23.43 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.45 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  23.43 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  23.36 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  26.02 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  26.91 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  23.45 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  24.5 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  22.88 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  23.43 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  26.02 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  25.1 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  21.67 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.87 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  23.95 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>