More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0739 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  558  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  59.36 
 
 
295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.5 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  27.37 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.86 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.86 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.5 
 
 
303 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  28.15 
 
 
301 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.5 
 
 
303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  34.28 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  28.67 
 
 
312 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  27.37 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.5 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.15 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.15 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  29.37 
 
 
301 aa  112  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.8 
 
 
303 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  29.6 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  29.6 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  29.6 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  29.51 
 
 
301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  29.51 
 
 
301 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  29.6 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  30 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  30 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  30.56 
 
 
301 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
305 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.59 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.25 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.85 
 
 
307 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.23 
 
 
305 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.51 
 
 
289 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.62 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.53 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  32.54 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.24 
 
 
313 aa  88.2  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  26.83 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.69 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  26.9 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.14 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  28.87 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  30 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
314 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.27 
 
 
274 aa  79  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
309 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.76 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 
348 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  28.17 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  32.28 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  26.55 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  30.21 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.76 
 
 
331 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  27.84 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 
304 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  31.1 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  27.84 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  27.84 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.3 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.8 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  28.89 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  28.43 
 
 
325 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.46 
 
 
309 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  30.69 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  30.69 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.11 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  28.97 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  23.66 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  27.24 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.01 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  27.95 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  29.43 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  29.58 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.23 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  26.67 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.57 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  27.61 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>