256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2099 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  82.2 
 
 		 320 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  62.77 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  70.1 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  65.13 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.91 
 
 		 315 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  64.24 
 
 		 333 aa  375  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.55 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  61.04 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  61.38 
 
 		 284 aa  323  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  43 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  43 
 
 		 302 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  42.76 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  43 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  42.33 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  42.33 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  42.33 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  43.79 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  41.25 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  40.59 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  40.59 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  40.59 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.78 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  40.07 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.06 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.44 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  40.67 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  40.58 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  40.47 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.74 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.64 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.32 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  34.92 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.25 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  28.53 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  29.61 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  28.16 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  27.59 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  27.59 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  27.59 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  28.08 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  43.97 
 
 		 154 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  43.97 
 
 		 154 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  28.67 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  28.67 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  39.71 
 
 		 143 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  39.71 
 
 		 143 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  28.39 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.52 
 
 		 315 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.25 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  29.69 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.46 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.86 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  22.37 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  29.24 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  27.69 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.15 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  27.81 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  27.36 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.11 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.88 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  23.77 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  28.48 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  26.22 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.92 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.26 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.44 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  28.82 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  29.86 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  22.88 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  29.27 
 
 		 236 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.49 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.18 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  24.5 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  29.84 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  22.62 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  29.84 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  29.84 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  28.11 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 314 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  24.54 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.47 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  24.19 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  22.73 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.02 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  23.75 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.82 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  25.09 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>