183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0791 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  100 
 
 
143 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  100 
 
 
143 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  92.81 
 
 
302 aa  260  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  92.81 
 
 
302 aa  260  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  91.37 
 
 
297 aa  258  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  258  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  90.65 
 
 
302 aa  257  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  92.09 
 
 
302 aa  258  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  91.37 
 
 
302 aa  255  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  97.2 
 
 
299 aa  254  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  81.69 
 
 
286 aa  237  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  89.86 
 
 
299 aa  221  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  82.39 
 
 
299 aa  219  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  70.45 
 
 
308 aa  185  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  69.72 
 
 
336 aa  173  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.31 
 
 
312 aa  168  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.79 
 
 
308 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  69.7 
 
 
302 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  42.86 
 
 
318 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  43.17 
 
 
320 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  40.15 
 
 
316 aa  111  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  41.79 
 
 
318 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  41.35 
 
 
284 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  39.71 
 
 
315 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 
308 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.24 
 
 
315 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  37.5 
 
 
333 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  42.74 
 
 
307 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  32.39 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  36.11 
 
 
300 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.35 
 
 
286 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  37.96 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  31.21 
 
 
319 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 
305 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 
305 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  29.79 
 
 
319 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  29.37 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.17 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.17 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.47 
 
 
303 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.55 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  28.17 
 
 
325 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  27.78 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.86 
 
 
302 aa  62  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.55 
 
 
303 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.55 
 
 
303 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.55 
 
 
303 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  27.59 
 
 
310 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  27.14 
 
 
331 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  27.14 
 
 
331 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  26.47 
 
 
319 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.79 
 
 
303 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.77 
 
 
315 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.79 
 
 
303 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.28 
 
 
317 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
301 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.5 
 
 
301 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 
298 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  29.29 
 
 
288 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.07 
 
 
317 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.28 
 
 
299 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  29.2 
 
 
311 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.68 
 
 
293 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
301 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 
309 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.12 
 
 
297 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  30.28 
 
 
308 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  28.06 
 
 
296 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
309 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  27.13 
 
 
309 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 
291 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  35.82 
 
 
312 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  30.63 
 
 
325 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  30.15 
 
 
305 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  30.15 
 
 
305 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.2 
 
 
291 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  28.99 
 
 
315 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  24.64 
 
 
305 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 
299 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.82 
 
 
310 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  21.71 
 
 
329 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  25.74 
 
 
345 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  29.73 
 
 
298 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.27 
 
 
294 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  28.86 
 
 
301 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  27.94 
 
 
299 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.91 
 
 
299 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  26.47 
 
 
319 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 
314 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.17 
 
 
305 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  35.53 
 
 
304 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 
289 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  27.94 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  27.94 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  37.31 
 
 
299 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  31.01 
 
 
305 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.28 
 
 
311 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>