More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1059 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  634    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  45.14 
 
 
312 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.84 
 
 
317 aa  192  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0911  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.62 
 
 
294 aa  176  6e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  34.64 
 
 
315 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.14 
 
 
294 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 
295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  29.59 
 
 
310 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  30.51 
 
 
297 aa  116  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  28.22 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.27 
 
 
308 aa  109  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 
323 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
289 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  27.7 
 
 
294 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  28.66 
 
 
317 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 
297 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  29.54 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.76 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.92 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.71 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.57 
 
 
397 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  26.26 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  26.26 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  26.26 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  24.76 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  26.39 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  27.76 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  29.44 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  0.15573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.01 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  25.93 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.35 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  25.93 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  26.1 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.67 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  25.84 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.97 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 
311 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  29.29 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  25.96 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.2 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  26.82 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.19 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  25.33 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.7 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.7 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  24.92 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  28.27 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  23.7 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.43 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  26.56 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  28.23 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  24.07 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.16 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.79 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  28.64 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.82 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25230  predicted permease, DMT superfamily  25.26 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66597  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.03 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  27.8 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  27.8 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  27.8 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  25.75 
 
 
331 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.7 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  27.8 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  27.8 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  27.8 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  27.8 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.7 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.34 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  21.99 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.37 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  24.67 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.7 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.34 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  24.9 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.92 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.92 
 
 
303 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.66 
 
 
289 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.16 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  25.61 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  24.9 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  24.9 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>