230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2106 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  37.04 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  35.2 
 
 
320 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  34.08 
 
 
308 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  36.12 
 
 
317 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  33.55 
 
 
318 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  32.35 
 
 
333 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 
308 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  34.22 
 
 
302 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  32.87 
 
 
299 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  35.2 
 
 
315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  32.87 
 
 
299 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  32.87 
 
 
299 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  32.87 
 
 
299 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  32.99 
 
 
302 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  32.87 
 
 
297 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  35.93 
 
 
307 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  32.65 
 
 
302 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
312 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  31.25 
 
 
302 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  33.46 
 
 
336 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  30.9 
 
 
302 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  30.9 
 
 
302 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  33.11 
 
 
318 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 
308 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  34.14 
 
 
300 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.56 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  30.56 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  30.56 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  34.01 
 
 
312 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  32.2 
 
 
319 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  34.01 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.29 
 
 
287 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  32.09 
 
 
319 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  30.85 
 
 
325 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  34.11 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  30.58 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  34.16 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  32.75 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  34.11 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  34.11 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  34.11 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.14 
 
 
296 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  31.01 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.2 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  31.14 
 
 
299 aa  85.9  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  39.23 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.05 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  29.5 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.57 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.57 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.28 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.19 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.19 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  27.3 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  31.29 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.19 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  28.19 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.19 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.19 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.68 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  31.46 
 
 
341 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  26.88 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  26.52 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.73 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  31.12 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.6 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  28.73 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  28.31 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  32.02 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  29.6 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  25.58 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  29.64 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  26.64 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  36.36 
 
 
154 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  36.36 
 
 
154 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.3 
 
 
306 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  30.14 
 
 
307 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.76 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  24.79 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.3 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.08 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.11 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  30.41 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>