More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1128 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  100 
 
 
312 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  98.88 
 
 
312 aa  497  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  99.15 
 
 
236 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  88.43 
 
 
311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  78.36 
 
 
319 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  79.48 
 
 
319 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  77.99 
 
 
325 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  77.24 
 
 
319 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  77.24 
 
 
310 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  77.24 
 
 
331 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  77.24 
 
 
331 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.07 
 
 
305 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.07 
 
 
305 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.23 
 
 
299 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.84 
 
 
301 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.12 
 
 
298 aa  228  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  54.44 
 
 
309 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  51.14 
 
 
300 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  52.96 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  51.92 
 
 
301 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  48.43 
 
 
294 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.88 
 
 
286 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 
286 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.93 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  32.47 
 
 
302 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  31.73 
 
 
302 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  33.96 
 
 
317 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  31.3 
 
 
299 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  31 
 
 
302 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  31 
 
 
302 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  31.06 
 
 
297 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  30.26 
 
 
302 aa  99  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  29.7 
 
 
299 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  29.32 
 
 
299 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  29.32 
 
 
299 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  29.32 
 
 
299 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  31.99 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  37.25 
 
 
307 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  36.4 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  30.27 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  31.18 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.62 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  28.83 
 
 
333 aa  89.7  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  28.68 
 
 
302 aa  89  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  29.57 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  29.37 
 
 
305 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  26.43 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  28.94 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  30.43 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.06 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  29.91 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.29 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.29 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  25.84 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.92 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.9 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  25.47 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  26.64 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  25.28 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  35.77 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  30.24 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.39 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.35 
 
 
341 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  21.46 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.08 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.09 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.83 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.37 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.94 
 
 
299 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.05 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  25.86 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  24.1 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 
302 aa  62.4  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  31.14 
 
 
294 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.45 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  25.79 
 
 
219 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.22 
 
 
286 aa  62  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.19 
 
 
301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  27.44 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.71 
 
 
312 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  27.44 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.07 
 
 
293 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  33.51 
 
 
296 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  30.72 
 
 
294 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  29.52 
 
 
294 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.95 
 
 
331 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.59 
 
 
299 aa  58.9  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  23.94 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 
286 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  33.51 
 
 
296 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>