More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1415 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 286 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  85.42 
 
 		 299 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  78.32 
 
 		 297 aa  447  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  77.66 
 
 		 302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  77.66 
 
 		 302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  77.66 
 
 		 302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  75.95 
 
 		 302 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  75.95 
 
 		 302 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  78.87 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  78.87 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  78.87 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  78.87 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  75.69 
 
 		 299 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  64.77 
 
 		 308 aa  345  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  65.4 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.49 
 
 		 312 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.07 
 
 		 308 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  65.7 
 
 		 302 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  81.69 
 
 		 143 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  81.69 
 
 		 143 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  76.87 
 
 		 154 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  76.87 
 
 		 154 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  40.2 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  42.7 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  40.21 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.16 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  40.82 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  39.06 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  37.79 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  40.6 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  40.68 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.73 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  43.9 
 
 		 317 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.4 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  31.96 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  35.79 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  34.04 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.84 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.13 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  32.48 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  32.58 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  32.32 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  33.08 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  30.9 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  31.46 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.71 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  30.9 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  30.71 
 
 		 331 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  30.71 
 
 		 331 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  30.82 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  32.86 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  31.12 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  31.12 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  32.85 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.5 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  32.26 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  32.26 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  32.26 
 
 		 268 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.94 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  31.3 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.94 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.94 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.21 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  32.89 
 
 		 236 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.21 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.57 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.84 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  27.57 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  27.92 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  27.47 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  27.47 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 291 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.2 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  28.87 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  27.76 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.09 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 320 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.91 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  26.58 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  30.98 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.2 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.46 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.48 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 355 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.87 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.68 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.9 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>