More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0805 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
286 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.73 
 
 
286 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  37.94 
 
 
297 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  37.81 
 
 
302 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  36.75 
 
 
302 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 
299 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  37.86 
 
 
287 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  36.14 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  37.23 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  37.23 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  37.94 
 
 
299 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 
299 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  36.52 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  34.49 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  37.33 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  35.11 
 
 
299 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  34.75 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  34.75 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  34.75 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  39.04 
 
 
319 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  35.89 
 
 
302 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  39.04 
 
 
319 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.21 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  38.7 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  38.7 
 
 
331 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  38.7 
 
 
331 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  36.75 
 
 
336 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 
312 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  38.95 
 
 
325 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.27 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  39.02 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  35.11 
 
 
299 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  38.43 
 
 
311 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  37.67 
 
 
296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  35.07 
 
 
309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  37.33 
 
 
319 aa  126  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  38.65 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  38.77 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  38.3 
 
 
312 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  32.64 
 
 
315 aa  118  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  36.8 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  31.23 
 
 
333 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 
315 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  32.17 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  37.7 
 
 
268 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  34.97 
 
 
317 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  37.7 
 
 
268 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  37.7 
 
 
268 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.72 
 
 
315 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  31.1 
 
 
318 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  30.45 
 
 
341 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  36.21 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
325 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.22 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  32.34 
 
 
289 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.94 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  32.16 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.65 
 
 
309 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.3 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.3 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  30.71 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.12 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.65 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.69 
 
 
299 aa  89  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.48 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  32.72 
 
 
307 aa  87  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  32.34 
 
 
328 aa  85.5  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  33.08 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  37.59 
 
 
154 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  37.59 
 
 
154 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  33.08 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  24.56 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.8 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  26.44 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  26.37 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  39.35 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
289 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  29.1 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  24.03 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.43 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  24.03 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.43 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  30.31 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.43 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.94 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.43 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  24.43 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  28.4 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.66 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  24.03 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  24.05 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  27.82 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  35.78 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.64 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>