More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1865 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  627  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.39 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  36.66 
 
 
305 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  41.87 
 
 
304 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  38.44 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  39.36 
 
 
341 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  39.06 
 
 
311 aa  159  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  34.6 
 
 
289 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.86 
 
 
325 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  35.2 
 
 
315 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 
292 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  38.13 
 
 
310 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  38.13 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  34.84 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  27.06 
 
 
309 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  28.95 
 
 
309 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  35.57 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  28.57 
 
 
309 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  29.1 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.82 
 
 
329 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  29.13 
 
 
219 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  30.82 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  29.28 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  30.3 
 
 
314 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  34.16 
 
 
309 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  30.8 
 
 
301 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  30.42 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  27.24 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  32.78 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  27.24 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.91 
 
 
303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  26.91 
 
 
303 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  26.91 
 
 
303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.91 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  27.24 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.19 
 
 
293 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.91 
 
 
303 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  27.24 
 
 
312 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  28.47 
 
 
319 aa  92.4  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  30.24 
 
 
294 aa  91.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  28.36 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.83 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.93 
 
 
304 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.69 
 
 
302 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  28 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.52 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  28.06 
 
 
307 aa  85.9  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.7 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  27.07 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  33.21 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  26.39 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  27.21 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  33.05 
 
 
308 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.21 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  28.48 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  26.34 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.57 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.97 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  30.07 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  29.67 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  27.9 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.62 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  29.01 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  29.45 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  28.95 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  30.07 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  29.79 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.39 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  27.54 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
348 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
305 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  26.5 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  24.2 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  23.26 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  28.2 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  30.91 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  31.39 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  27.54 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.83 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.49 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  25.41 
 
 
309 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.6 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  30.51 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.49 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  26.46 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.66 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.32 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  29.31 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  23.84 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.84 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.84 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  32.62 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  32.62 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>